<div dir="ltr"><div><div><div>Hi, I have merged the test in hdf5.m4 into the <a href="http://configure.ac" target="_blank">configure.ac</a> file in psurface folder and changed Makefile.am. Now we can test hdf5 library successfully during configure. <br>

<br></div>The psurface folder could now be cloned to another computed and compiled there. I have test it with my friend's computer. In order to compile the folder, you need to:<br></div>1. Install the hdf5 library using the source code down load from here <a href="http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/" target="_blank">http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/</a><br>

</div>The compile it with the commend:<br> ./configure --prefix=/usr/local/hdf5<br> make<br> make check<br> make install<br> sudo make install<br><div><div><br></div><div>I have problem testing the library when I use the pre-built binary distributions. So don't use  the pre-built binary distributions to install hdf5. <br>

<br>2. use <br>sudo ./configure --prefix=psurface_install_folder  --with-amiramesh=amira_install_folder  -with-hdf5=/usr/local/hdf5/(hdf5 folder) --disable-shared<br> <br></div></div><div class="gmail_extra">Best,<br></div>
<div class="gmail_extra">Xiaoxue<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">
On Fri, Aug 30, 2013 at 6:15 AM, Markus Blatt <span dir="ltr"><<a href="mailto:markus@dr-blatt.de" target="_blank">markus@dr-blatt.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

Hi,<br>
<br>
where do I find the code? Somehow how failed to see your recent commits in<br>
gitorious.<br>
<div><br>
On Fri, Aug 30, 2013 at 05:13:58AM -0400, Xiaoxue Gong wrote:<br>
> Hi!<br>
><br>
> Last week I was polishing the psurface-convert code.<br>
> Now the code could work. I have update both the source<br>
> code(psurface_convert.cpp and psurface_convert.h) and the executable<br>
> file(psurface_convert) into my git directory.<br>
> (I will remove the executable file after my code could be compiled on other<br>
> computer. You could now download the executable file and test it.)<br>
<br>
</div>I highly doubt that this will work as I assume that it is partially<br>
linked dynamically. What does ldd <binary> output?<br>
<br>
You should really remove ASAP. Binaries should never be in a<br>
repository.<br>
<div><br>
> Currently there are other problems with compiling the code after moving all<br>
> static path in Makefile.am. Although I can compile it on my computer, it<br>
> could not be compiled successfully on other computer. In fixing that,  I<br>
> have to write a hdf5 test in <a href="http://configure.ac" target="_blank">configure.ac</a>  and test it on another computer.<br>
<br>
</div>Don't reinvent the wheel and waste time. There is a test in<br>
dune-common/m4/hdf5.m4. Please copy that one.<br>
<span><font color="#888888"><br>
Markus<br>
--<br>
Do you need more support with DUNE or HPC in general?<br>
<br>
Dr. Markus Blatt - HPC-Simulation-Software & Services <a href="http://www.dr-blatt.de" target="_blank">http://www.dr-blatt.de</a><br>
Hans-Bunte-Str. 8-10, 69123 Heidelberg, Germany<br>
Tel.: <a href="tel:%2B49%20%280%29%20160%2097590858" value="+4916097590858" target="_blank">+49 (0) 160 97590858</a>  Fax: +49 (0)322 1108991658<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Dune-devel mailing list<br>
<a href="mailto:Dune-devel@dune-project.org" target="_blank">Dune-devel@dune-project.org</a><br>
<a href="http://lists.dune-project.org/mailman/listinfo/dune-devel" target="_blank">http://lists.dune-project.org/mailman/listinfo/dune-devel</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div></div>