<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
That looks like a memory cache issue. What is the memory configuration for desktop versus laptop? There may be more than one cache involved (disk cache, Ram cache, CPU cache).</div>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> Dune-devel <dune-devel-bounces@lists.dune-project.org> on behalf of Flemisch, Bernd <bernd.flemisch@iws.uni-stuttgart.de><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, December 15, 2020 4:59 AM<br>
<b>To:</b> dune-devel@lists.dune-project.org <dune-devel@lists.dune-project.org><br>
<b>Subject:</b> Re: [Dune-devel] Long MPI startup</font>
<div> </div>
</div>
<style>
<!--
.x_EmailQuote
        {margin-left:1pt;
        padding-left:4pt;
        border-left:#800000 2px solid}
-->
</style>
<div>
<meta content="text/html; charset=UTF-8">
<style type="text/css" style="">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div dir="ltr">
<div id="x_x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p>Just to let you know that you're not alone. I experience the same issue on my rather new laptop with Ubuntu 20.04 and 20.10. Both for OpenMPI and MPICH. And only for the first of several consecutive runs, try</p>
<p>./a.out && ./a.out && ./a.out</p>
<p><br>
</p>
<p>I don't have that problem on my desktop which still runs on openSUSE 15.0. Kind of hard to bisect this.</p>
<p><br>
</p>
<p>Kind regards</p>
<p>Bernd</p>
<p><br>
</p>
<div id="x_x_Signature">
<div id="x_x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:rgb(0,0,0); font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<div><span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">--</span><br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">_________________________________________________________________</span><br>
<br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">Bernd Flemisch</span><br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">IWS, Universität Stuttgart               phone: +49 711 685 69162</span><br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">Pfaffenwaldring 61              email: bernd@iws.uni-stuttgart.de</span><br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">D-70569 Stuttgart           url:
<a href="http://www.iws.uni-stuttgart.de/en/lh2/" class="x_x_OWAAutoLink" title="http://www.iws.uni-stuttgart.de/en/lh2/ Ctrl+Klicken oder tippen Sie, um dem Link zu folgen." id="LPNoLP">
www.iws.uni-stuttgart.de/en/lh2/</a></span><br>
<span style="font-family:"Courier New",monospace; font-size:10pt">_________________________________________________________________</span></div>
</div>
</div>
</div>
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="x_x_divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>Von:</b> Dune-devel <dune-devel-bounces@lists.dune-project.org> im Auftrag von Oliver Sander <oliver.sander@tu-dresden.de><br>
<b>Gesendet:</b> Dienstag, 15. Dezember 2020 11:34:48<br>
<b>An:</b> dune-devel@lists.dune-project.org<br>
<b>Betreff:</b> Re: [Dune-devel] Long MPI startup</font>
<div> </div>
</div>
</div>
<font size="2"><span style="font-size:10pt">
<div class="x_PlainText">Hi Markus,<br>
<br>
thanks for your help.  Indeed, your test program also requires<br>
about 2.5 seconds to terminate, so there really is nothing<br>
Dune-specific about it.<br>
<br>
It is still annoying though.  My machine is a recent-ish ThinkPad Yoga,<br>
with 8 cores, running Debian Testing.  I suppose I'll just have to<br>
suck it up.<br>
<br>
Best,<br>
Oliver<br>
<br>
On 15.12.20 10:19, Markus Blatt wrote:<br>
> Hi,<br>
> <br>
> <br>
> On Fri, Dec 11, 2020 at 12:19:56PM +0100, Oliver Sander wrote:<br>
>><br>
>> I recently noticed that on my system (current Debian testing), the call to<br>
>><br>
>>    MPIHelper::instance(argc, argv);<br>
>><br>
>> takes between 2 and 3 seconds to complete.  This seems like a long time to me.<br>
>> Is it to be expected?  Or is there a bug somewhere?<br>
> <br>
> I don't think that we do anything specical during startup (besides calling<br>
> MPI_Init). Hence I doubt that this is a Dune problem.<br>
> <br>
> Maybe you cound try a minimal MPI program to compare?<br>
> <br>
> #include <mpi.h><br>
> #include <iosteam><br>
> <br>
> int main(int argc, char** argv){<br>
>    MPI_Init(&argc, argv);<br>
>    int size, rank;<br>
>    MPI_Comm_size(&size, MPI_COMM_WORLD);<br>
>    MPI_Comm_rank(&rank, MPI_COMM_WORLD);<br>
>    //Above should be all that DUNE does<br>
>    std::cout<<"Hi, I am rank "<<rank<<" of "<<size<<"."<<std::endl;<br>
>    MPI_Finalize();<br>
>    return 0;<br>
> }<br>
> <br>
> BTW on my multicore machine (32 cores) it takes some time, too.<br>
> Mabe you have a new machine? What MPI?<br>
> <br>
> HTH,<br>
> <br>
> Markus<br>
> <br>
<br>
</div>
</span></font></div>
</body>
</html>